Нет, перевыпуск карты не влияет на начисление пособия, если новая карта будет привязана к тому же банковскому счету.
А вот если у вас изменились реквизиты счета уже после назначения пособия, то нужно подать заявление на смену реквизитов с новыми данными в Соцфонд. Как это сделать - в нашем посте